Superkomputery pomogą w walce z koronawirusem. Gigantyczna moc obliczeniowa przyspieszy prace nad lekami i szczepionką

Superkomputery i technologia obliczeniowa o wysokiej wydajności pomogą walczyć z koronawirusem. Ostatnie tygodnie to szereg inicjatyw, które mają na celu pozyskanie danych i wykorzystanie algorytmów SI, superkomputerów i wiedzy specjalistycznej w walce z trudną sytuacją epidemiologiczną. Przykładem mogą być kompletne, wydajne systemy obliczeniowe AMD, które trafią do trzech amerykańskich uniwersytetów i zapewnią ponad siedem petaflopsów mocy obliczeniowej do walki z COVID-19.

Szybsze przetwarzanie i analizowanie większej liczby danych może zapobiec rozprzestrzenianiu się przyszłych pandemii, pomoże w zaprojektowaniu skutecznych metod leczenia i opracowaniu skutecznych szczepionek. Superkomputery – wydajne, dysponujące ogromną mocą – mogą pomóc w wynalezieniu skutecznego lekarstwa czy szczepionki. Ze względu na pojawienie się COVID-19 powstaje coraz więcej globalnych inicjatyw, które mają pomóc w walce z pandemią.

Już blisko milion osób dodało swoje komputery domowe do rozległej sieci, która tworzy wirtualny superkomputer o nazwie Folding@home. Projekt wykorzystuje crowdsourcingową moc obliczeniową, żeby przeanalizować białka znalezione w koronawirusie. Korzystając z symulacji komputerowych, badacze mapują białka koronawirusa i szukają luk, które mogą zostać zaatakowane nowymi lekami. Im więcej wolontariuszy – tym większa moc komputera.

– Duża moc obliczeniowa odgrywa kluczową rolę we współczesnych badaniach nad wirusami, pogłębiając nasze zrozumienie działania określonych wirusów i ostatecznie przyspieszając rozwój potencjalnych leków i szczepionek – podkreśla Lisa Su, prezes i dyrektor generalny AMD. – AMD i nasi partnerzy technologiczni zapewniają naukowcom z całego świata nowe systemy, które zwiększą możliwości obliczeniowe dostępne do walki z COVID-19 i będą wspierać przyszłe badania medyczne.

Konsorcjum Digital Transformation Institute ogłosiło z kolei projekt „Techniki SI w celu złagodzenia pandemii”. Najlepsi, oprócz nagród pieniężnych, otrzymają dostęp do superkomputera czy oprogramowania SI. Wszystko po to, by opracować skuteczną metodę walki z pandemią. Z kolei amerykańskie uczelnie –  New York University, Massachusetts Institute of Technology oraz Rice University – otrzymały wydajne systemy obliczeniowe zasilane przez AMD.

Docelowo uczelnie mają wykorzystać siedem petaflopsów mocy obliczeniowej do opracowania szczepionek, ale też lepszego poznania koronawirusa.

– Pandemia COVID-19 wywarła głęboki wpływ na badania w szkolnictwie wyższym, zarówno w zakresie ich kierunku, jak i potrzeby natychmiastowych rezultatów – mówi Russel Caflisch, dyrektor Instytutu Nauk Matematycznych im. Richarda Couranta na Uniwersytecie Nowojorskim. – Zasoby obliczeniowe przekazane przez AMD zostaną wykorzystane przez badaczy z NYU z wielu różnych dyscyplin w projektach dotyczących wielu ważnych aspektów kryzysu związanego z koronawirusem, w tym: odkrycia leków na COVID-19 i przyszłe mutacje wirusa SARS, wyszukiwania odpowiednich wyników badań z obszernej literatury biomedycznej czy analizy obrazowania medycznego do badań przesiewowych pacjentów.

Działania AMD to niejedyny przykład udostępniania superkomputera naukowcom. Konsorcjum HPC (COVID-19 High Performance Computing) zapewnia szeroki dostęp do ponad 30 superkomputerów z 402 petaflopsami mocy. IBM udostępnia zasoby superkomputerowe, repozytoria danych w chmurze i narzędzia wyszukiwania oparte na sztucznej inteligencji. Exscalate4CoV (E4C), koalicja badaczy z siedmiu krajów europejskich (w tym z Polski), współpracuje w celu zwalczania rozprzestrzeniania się koronawirusa. Koordynowany przez włoską firmę farmaceutyczną Dompé, dysponujący trzema potężnymi ośrodkami obliczeniowymi o wysokiej wydajności w Bolonii, Barcelonie i Jülich, poszukuje potencjalnych leków do walki z COVID-19.